Lemmikkieläimen tunnistusmerkinnällä tarkoitetaan eläimen merkitsemistä joko mikrosirulla tai tatuoinnilla. Mikrosiru on niskaan laitettava tunnistesiru, mikä voidaan lukea mikrosirun lukulaitteella. Yleensä se laitetaan koiralle pentuiässä. Tatuointia käytetään nykyään enää harvoin.
Euroopan yhteisön alueella kaikki maahantuotavat koirat, kissat, hillerit ja fretit on oltava tunnistusmerkitty mikrosirulla tai selkeästi luettavalla tatuoinnilla. Vuoden 2010 jälkeen eläimellä hyväksytään tunnistusmerkintänä ainoastaan mikrosiru.
Kaikkiin virallisiin koe-, näyttely- ja muihin tapahtumiin osallistuvilla koirilla pitää olla tunnistusmerkintä.
Suomen Kennelliitto ylläpitää tunnistusmerkintärekisteriä, johon voidaan ilmoittaa tunnistusmerkityt rekisteröimättömät ja sekarotuiset koirat.
Suomen Kissaliitto ry ylläpitää kissojen vapaaehtoista mikrosirurekisteriä. Rekisteröidyt ja rekisteröimättömät kissat voidaan merkitä ja ilmoittaa Kissaliiton rekisteriin.